A hiljutine uuring tuvastab the,en uudne koronaviirus, mis põhjustab kopsupõletiku epideemia Hiinas Hubei provintsis- nahkhiire päritoluviirus on seotud teiste teadaolevate patogeensete koronaviirustega
. 2019 uudne koronaviirus (CoV) põhjustab surmaga lõppenud kopsupõletikku, mis on nõudnud üle 1300 inimelu, kusjuures enam kui 52000 kinnitatud 13. veebruar 2020 - kõik veidi üle kuu. Aga mis see viirus on? Kas see on üldse uus viirus? Kust see tuli? Hiina tippuuringute instituutide teadlased ühinesid neile küsimustele vastamiseks ja see teerajaja uuring on avaldatud aastal Hiina meditsiiniajakiri.
https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs
Detsembri alguses hakkasid vähesed Hiina Hubei provintsis Wuhani linnas haigestuma pärast kohalikule mereandide turule minekut. Neil esines selliseid sümptomeid nagu köha, palavik ja õhupuudus ning isegi ägeda respiratoorse distressi sündroomiga (ARDS) seotud tüsistused. Kohene diagnoos oli kopsupõletik, kuid täpne põhjus oli seletamatu. Mis selle uue haiguspuhangu põhjustas? Kas see on raske äge respiratoorne sündroom (SARS) -CoV? Kas see on Lähis-Ida respiratoorne sündroom (MERS) -CoV? Nagu selgub, olid teadlased selle viiruse tuvastamiseks detsembris pärast esimeste juhtumite analüüsimist läbi viinud uuringu. See uuring on nüüd avaldatud aastal Hiina meditsiiniajakiri ja viiruse identiteet on kindlaks tehtud - see on täiesti uus viirus, mis on tihedalt seotud nahkhiire SARS-i sarnase CoV-ga. Uuringu juhtivteadur dr Jianwei Wang (Hiina meditsiiniteaduste akadeemia, patogeenibioloogia instituut) ütleb:Meie paber on tuvastanud nahkhiirte päritolu CoV identiteedi, mis seni ei olnud teada."
Selles uuringus avastasid ja tuvastasid Hiina tunnustatud uurimisinstituutide, näiteks Hiina meditsiiniteaduste akadeemia, patogeenibioloogia instituudi, Hiina-Jaapani sõprushaigla ja Pekingi liidu meditsiinikolledži teadlased uue CoV - peamise süüdlase Wuhani puhang - järgmise põlvkonna sekveneerimisega (NGS). Nad keskendusid viiele Wuhani Jin Yin-tan haiglasse sattunud patsiendile, kellest enamik olid töötajad Wuhani Huanani mereandide turul. Nendel patsientidel oli kõrge palavik, köha ja muud sümptomid ning esialgu diagnoositi neil kopsupõletik, kuid selle põhjus oli teadmata. Mõne patsiendi seisund halvenes kiiresti ARDS-ni; üks isegi suri. Dr Wang ütleb:Patsientide rindkere röntgenpildid näitasid kopsupõletikule omaseid häguseid hägususi ja konsolideerumisi. Tahtsime siiski teada saada, mis põhjustas kopsupõletiku, ja meie järgnevad katsed näitasid täpse põhjuse- uus CoV, mida varem ei tuntud."
Uuringu jaoks kasutasid teadlased patsientidelt võetud bronhoalveolaarse pesemise (BAL) vedeliku proove (BAL on protseduur, mille käigus steriilne vedelik viiakse bronhoskoobi kaudu kopsudesse ja kogutakse seejärel analüüsimiseks).
Esiteks üritasid teadlased tuvastada viirust genoomide järjestamise teel, kasutades NGS-tehnoloogiat. NGS on eelistatud sõelumismeetod tundmatute patogeenide tuvastamiseks, kuna see tuvastab ja välistab kiiresti kõik proovis teadaolevad patogeensed mikroorganismid. BAL-vedeliku proovide DNA / RNA sekveneerimise põhjal leidsid teadlased, et enamik viiruse lugemisi kuulus CoV perekonda. Seejärel panid teadlased kokku erinevad "lugemised", mis kuulusid CoV-dele, ja koostasid uue viiruse jaoks terve genoomse järjestuse; need järjestused olid kõigi patsientide proovide seas 99.8–99.9% sarnased, mis kinnitas, et see viirus oli kõigil patsientidel tavaline patogeen. Lisaks kinnitasid nad homoloogianalüüsi abil, kus genoomijärjestust võrreldakse teiste teadaolevate genoomijärjestustega (mille eelseadistatud lävi on 90%, et seda saaks pidada uueks järjestuseks), et selle uue viiruse genoomijärjestus on 79.0% sarnane SARS-CoV-ga, umbes 51.8% sarnane MERS-CoV-ga ja umbes 87.6–87.7% sarnane teiste hobuseraua nahkhiirte SARS-i sarnaste CoV-dega (nn ZC45 ja ZXC21). Fülogeneetiline analüüs näitas, et saadud viie CoV tüve järjestused olid kõige lähemal nahkhiirest saadud tüvede järjestustele, kuid moodustasid eraldi evolutsiooniharud. Need leiud viitavad selgelt sellele, et viirus pärineb nahkhiirtelt. Dr Wang kinnitab:Kuna viiruse replikaasigeeni sarnasus kõigi teiste teadaolevate “sarnaste” viirustega on endiselt alla 90%, ning võttes arvesse ka fülogeneetilise analüüsi tulemusi, leiame, et see on tõepoolest uus, varem tundmatu CoV. Seda uut viirust nimetatakse ajutiselt 2019. aastaks-ncov."
Lõpuks siirdusid teadlased viiruse BAL-vedeliku proovidest "isoleerimisele", kontrollides, kas vedeliku proovid näitasid laboris tsütopaatilist toimet rakuliinidele. Vedelikuproovidega kokku puutunud rakke vaadeldi elektronmikroskoobi all ja teadlased leidsid iseloomulikud CoV-laadsed struktuurid. Nad kasutasid ka immunofluorestsentsi - tehnikat, milles kasutatakse fluorestsentsvärvidega märgistatud spetsiifilisi antikehi. Selleks kasutasid nad paranenud patsientide seerumit (mis sisaldas antikehi), mis reageeris raku sees olevate viirusosakestega; see kinnitas, et see viirus oli tõepoolest nakkuse põhjus.
See uuring sillutab teed tulevastele uuringutele viiruse ja selle allikate paremaks mõistmiseks, eriti arvestades selle kiiret levikut, võimet põhjustada surmaga lõppevat ARDS-i ja haiguspuhangust tingitud paanikat. Ehkki 4 viiest patsiendist, kellelt see viirus tuvastati, olid pärit Wuhani mereandide turult, pole nakkuse täpne päritolu teada. CoV oleks võinud inimestele levida „vahepealse” kandja kaudu, näiteks SARS-CoV (palmide siidliha) või MERS-CoV (kaamel) korral. Dr Wang järeldab:Kõik inimese CoV-d on zoonootilised ja mitmed inimese CoV-d on pärit nahkhiirtelt, sealhulgas SARS- ja MERS-CoV-d. Meie uuring näitab selgelt tungivat vajadust korrapärase seire järele nahkhiirte päritolu CoV-de leviku üle inimestele. Selle viiruse esilekutsumine on suur oht rahvatervisele ja seetõttu on ülitähtis mõista selle viiruse allikat ja otsustada järgmised sammud, enne kui oleme tunnistajaks ulatuslikumale haiguspuhangule. "
