21. jaanuarist kuni 23. veebruarini 2020 avastasid rahvatervise asutused 14 USA koronaviiruse haiguse 2019 juhtumit (COVID-19), mis kõik olid seotud Hiinast pärit reisidega (1,2). Esimene USA-sse mitteseotud reisijuhtum kinnitati 26. veebruaril California elanikul, kes oli haigeks jäänud 13. veebruaril (3). Kaks päeva hiljem, 28. veebruaril, kinnitati Washingtoni osariigis teine reisimisega mitteseotud juhtum (4,5). Nelja tõendusmaterjali uurimine annab ülevaate COVID-2 põhjustava viiruse SARS-CoV-19 USA-sse sissetoomise ja varajase edastamise ajast enne nende kahe juhtumi avastamist.
Esiteks ei näidanud pandeemia varakult mõjutatud maakondade erakorralise meditsiini osakonna andmetel põhinev sündroomiseire enne 19. veebruari COVID-28-laadsete haiguste külastuste arvu suurenemist. Teiseks, retrospektiivse SARS-CoV-2 testimisega, milles osales ligikaudu 11,000 1 hingamisteede proovi mitmest USA 20. jaanuari algusest pärit asukohtades ei leitud enne 18. veebruari positiivseid tulemusi. Kolmandaks näitas varasemate juhtumite viiruslike RNA järjestuste analüüs, et Hiinast otse või kaudselt imporditud viiruse üks liin hakkas USA-s ringlema 9. jaanuarist 2. veebruarini, järgnes mitme SARS-CoV-XNUMX impordi kaudu Euroopast.
Lõpuks kolme juhtumi esinemine: üks 6. veebruaril surnud California elanikust, teine sama maakonna elanikust, kes suri 17. veebruaril, ja kolmas tuvastamata reisijast või meeskonnaliikmest Vaikse ookeani kruiisilaeva pardal, mis lahkus San Francisco 11. veebruaril kinnitab viiruse salakaval ringlus veebruari alguseks. Need andmed näitavad, et pidev ühenduse levik oli alanud enne kahe esimese USA-ga mitteseotud reisijuhtumi avastamist, mis tõenäoliselt tulenes jaanuari lõpus või veebruari alguses Hiinast ühe viiruse liini impordist, millele järgnes mitu importi Euroopast. COVID-19 laialdane esilekerkimine kogu USA-s pärast veebruari rõhutab tugevate rahvatervishoiusüsteemide tähtsust tekkivatele nakkusohtudele kiireks reageerimiseks.
Sündroomseire
Riikliku sündroomseireprogrammi kaudu saavad USA rahvatervise agentuurid reaalajas andmeid 4,000 USA osariigi ja Columbia ringkonna ligikaudu 47 tervishoiuasutuse kiirabiosakondadest. 14 maakonnas, kus varakult omandatud kogukonnaga omandatud COVID-19 juhtumid, ei täheldatud COVID-19 sarnaste haiguste (palavik ja köha või õhupuudus või hingamisraskused või koronaviiruse diagnostilise koodi loetelu) olulist suurenemist. enne 28. veebruari.
Ägeda SARS-CoV-2 nakkuse seire Seattle'i gripiuuring (5) alustas ägedate hingamisteede haiguste seiret Seattle'i pealinnas 2018. aasta novembris. 2020. aasta veebruari lõpus alustati uuringus proovide kasutamist pöördtranskriptsiooni – polümeraasi ahelreaktsiooni (RT- PCR) testimine SARS-CoV-2 jaoks. Esimene positiivne laboratoorsed tulemused SARS-CoV-2 kohta tuvastati 28. veebruaril proovilt, mis koguti 24. veebruaril. Pärast seda avastamist testiti varem kogutud deidentiseeritud proovid viiruse suhtes tagasiulatuvalt. 5,270. jaanuarist 1. veebruarini (20) kogutud 5 hingamisteede proovi seas positiivseid tulemusi ei olnud (T. Bedford, Fred Hutchinsoni vähiuuringute keskus, Seattle, Washington, isiklik suhtlus, 6. mai 2020). Esimene retrospektiivselt testitud proovide seas positiivne test oli kogutud 21. veebruaril. 21. veebruaril algava nädala jooksul oli 1,255 proovist kaheksa (0.6%) positiivne ja järgmise nädala jooksul 29 katsetatud 1,862 (1.6%) proovist. positiivne. Kaks gripivaktsiini efektiivsuse uurimisvõrgustikku, kus on saidid kuues osariigis (Michigan, Pennsylvania, Tennessee, Texas, Washington ja Wisconsin), testiti retrospektiivselt ägeda hingamisteede haigusega patsientide hingamisteede proove SARS-CoV-2 suhtes RT-PCR abil. Washingtoni saidil ei olnud 497. jaanuari – 19. veebruari jooksul kogutud 24 proovist ükski positiivne; esimene proov, mille test oli positiivne, koguti 25. veebruaril. Viies muus kohas (Ann Arbor ja Detroit, Michigan; Pittsburgh, Pennsylvania; Temple, Texas; Marshfield, Wisconsin; ja Nashville, Tennessee) ei võetud jaanuari jooksul kokku ühtegi 2,620 proovist. 19. – 29. Veebruaril oli SARS-CoV-2 test positiivne. 22. mai 2020 seisuga on neli (<0.2%) umbes 3,000 proovist, mis on kogutud 18. jaanuarist kuni 1. märtsini uude vaktsiinide seirevõrku † registreeritud alla 31-aastastelt lastelt ja noorukitelt. Uuring on SARS-CoV-2 suhtes positiivne. Varaseim positiivne tulemus saadi proovist, mis koguti 20. märtsil Seattle'is.
Fülogeneetiline analüüs
Analüüsides SARS-CoV-2 genoomset mitmekesisust varasematest Seattle'i piirkonna COVID-19 juhtumitest, leiti, et enamik viirusi kuulus ühte klaasi (Washingtoni osariigi klad), mille viimane ühine esivanem oli hinnanguliselt olnud umbes 18. jaanuar ja 9. veebruar (hinnanguline hinnang = 1. veebruar) .§ Selle eellasviiruse prognoositav genoomne järjestus oli kooskõlas USA esimese imporditud COVID-19 juhtumiga, mis esines mehel, kes saabus Hiinast Wuhanist Seattle'i , 15. jaanuaril ja haigestus 4 päeva hiljem. Kuid on ka võimalik, et Washingtoni osariigi klad tekkis sarnase või identse järjestusega viirusest, mis pärines SARS-CoV-2 nakkusega inimeselt. Viiruseanalüüs Californias ja Ameerika Ühendriikide kirdeosas veebruarist märtsi keskpaigani näitas, et viirusi on imporditud mitu korda, peamiselt Euroopast, millele järgneb viiruse levik Ameerika Ühendriikides.
Teadaolevad juhtumid isikutel, kellel puudub asjakohane reisiajalugu
Enne 26. veebruari juhtus Californias Santa Clara maakonnas kaks märkimisväärset COVID-19 juhtumit: üks naisest, kes haigestus 31. jaanuaril ja suri 6. veebruaril, ja teine seosetu mehega, kes suri kodus ajavahemikus 13. – 17. Kumbki polnud surmale eelnenud nädalatel rahvusvaheliselt reisinud. SARS-CoV-2 RNA tuvastati RT-PCR testimisega CDC-l nende patsientide surnukeha järgsetest koeproovidest. Arst kontrollis nende surmade kinnitust COVID-19-ga seotud surmajuhtumiteks. Nende juhtumite uurimine käib. COVID-19 puhangud tekkisid kruiisilaeva Grand Princess kahel järjestikusel reisil (7). Nende puhangute viiruste genoomne järjestus oli Washingtoni osariigi kladis, mis viitab sellele, et selle viirusega nakatunud reisija või meeskonnaliige viibis laeval pardal, kui ta 11. veebruaril San Francisco sadamast edasi-tagasi kruiisiks väljus. Selle isiku isik pole teada. Arutelu Nendest erinevatest andmeallikatest pärinev teave viitab sellele, et SARS-CoV-2 levitamine Ühendriikides toimus jaanuari teise poole ja veebruari alguse vahel pärast SARS-CoV-2 importimist Hiinast. See import algatas põlvkonna, Washingtoni osariigi kladi, mis levis hiljem kogu Seattle'i suurlinnas ja võib-olla ka mujal. Veebruaris ja märtsis järgnes mitu SARS-CoV-2 impordi Euroopast. Pole teada, kui palju USA-d infektsioonid esinesid veebruaris ja märtsis, kuid üldine haigestumus enne 28. veebruari oli erakorralise meditsiini osakonna sündroomijälgimise andmete põhjal liiga madal. Samuti pole teada imporditud viiruste USA-sse sisenemise kuupäevad ja neid kandnud isikute andmed. Üks võimalik varajane allikas on esimene teatatud USA COVID-19 juhtum, mis leidis aset Washingtoni mehel, kes haigestus 19. jaanuaril pärast 15. jaanuaril Hiinast Wuhanist naasmist; sellest mehest eraldatud viiruse genoomne järjestus on kooskõlas sellega, et ta on Washingtoni osariigi kladi võimalik allikas, kuigi selle juhtumi kontaktijuurdluse põhjalikkus ja tuvastatud sekundaarsete juhtumite puudumine vaidlevad sellele vastu (8). Hilisemad avaldatud aruanded on siiski näidanud, et SARS-CoV-2 nakatumine on sageli asümptomaatiline ja nakatumine võib toimuda enne sümptomite tekkimist (9). Presümptomaatilise edasikandumise võimalus tõstatab vähemalt kolm muud selle juhtumiga seotud potentsiaalset stsenaariumi: 1) patsiendi kontaktide hulgas võis esineda üks või mitu sekundaarset asümptomaatilist infektsiooni ja see viis viiruse edasise, märkamatu levikuni; 2) et mehel võivad olla nakatunud kontaktid enne sümptomite ilmnemist (selliseid kontakte ei oleks sel ajal tavapärase soovitatud kontaktiuuringu abil tuvastatud); või 3) et tema ja veel vähemalt üks inimene nakatus samal reisil Wuhanist teise reisija poolt ja teiste nakatunud isikute avastamata levik põhjustas Washingtoni osariigi kladiidi. Milline neist stsenaariumidest tekkis, kui neid üldse on, ei saa kunagi teada. Võttes arvesse SARS-CoV-2 tolleaegset piiratud ülemaailmset fülogeneetilist mitmekesisust, on võimalik, et Washingtoni osariigi kladi importis USA-sse samal ajal teine tundmatu isik. Seroloogiliste testide tulemusi siin ei esitata, sest seroloogia (st SARS-CoV-2 antikehade testimine) on tõenäoliselt suhteliselt tundetu viis äsja tekkiva viiruse tuvastamiseks, eriti kui proovid koguti juhuslikult, mitte isikud, kes on kõige tõenäolisemalt nakatunud (vastupidiselt näiteks ambulatoorsete või hospitaliseeritud ägeda hingamisteede haigusega patsientide viirusekontrollile) ja kuna seroloogilised analüüsid ei lähene üldjuhul 100% spetsiifilisusele, välja arvatud juhul, kui on olemas mingisugune kinnitav test. Näiteks hüpoteetiline seroloogiline uuring Seattle'i pealinnas (elanikkond 3.5 miljonit), mis viidi läbi pärast esimest 3,500 nakkust, leidis tõelise seroprevalentsi 0.1%, samas kui 99% spetsiifilisusega testi kasutamine eeldab valepositiivseid tulemusi 10 korda rohkemates proovides. Sellegipoolest on seroloogilised uuringud kasulikud pandeemia progresseerumise jälgimisel, kui need on kindlaks tehtud, ja nende potentsiaalne eelis on kõigi nakkuste avastamine, hoolimata sümptomite profiilist. Selle aruande leidude suhtes kehtivad vähemalt kolm piirangut. Esiteks on siin esitatud andmed tagasiulatuvad. Ehkki nad on geograafiliselt erinevad, ei suuda nad anda nii lõplikku ülevaadet levikust, kui see oleks olnud kättesaadav, kui laialdane testimine oleks olnud kohe kättesaadav pärast viiruse avastamist. Teiseks jätkavad mõned viidatud uuringud ja võib-olla ka teised proovide tagantjärele testimist ning võivad leida varasemaid juhtumeid kui käesolevas aruandes esitatu. Lõpuks piiras SARS-CoV-2 suhteline fülogeneetiline homogeensus kogu maailmas jaanuaris ja veebruari alguses seda, mida võis järeldada genoomianalüüsist. Vähesed riigid on vältinud COVID-19 importi ja püsivat levikut. Ameerika Ühendriikides levib SARS-CoV-2 nüüd laialdaselt pärast mitut importi Hiinast, Euroopast ja mujalt. Sammud käivad kogu USA-s rahvatervise süsteem, et parandada SARS-CoV-2 aktiivsuse näitajaid, sealhulgas laiendada hädaosakondade sündroomseiret ja suurendada SARS-CoV-2 testimise kättesaadavust. Arvestades tõenäosust, et enamik USA-st
#rekonstrueeriminereis
MIDA SELLEST ARTIKLIst ÄRA VÕTTA:
- Finally, the occurrence of three cases, one in a California resident who died on February 6, a second in another resident of the same county who died February 17, and a third in an unidentified passenger or crew member aboard a Pacific cruise ship that left San Francisco on February 11, confirms cryptic circulation of the virus by early February.
- In 14 counties with early community-acquired cases of COVID-19, no substantial increase was observed in the proportion of COVID-19–like illness (fever and cough or shortness of breath or difficulty breathing, or the listing of a coronavirus diagnostic code) before February 28.
- Third, analysis of viral RNA sequences from early cases suggested that a single lineage of virus imported directly or indirectly from China began circulating in the United States between January 18 and February 9, followed by several SARS-CoV-2 importations from Europe.
